郑永唐/张驰宇团队合作在我国吸毒人群HIV/HCV共感染患者中发

圆环病毒（Circovirus）是以单链环状DNA为基因组的无包膜DNA病毒，基因组大小约2000nt左右，是迄今发现的最小动物病毒之一。最为熟知的圆环病毒是感染并可导致猪死亡的猪圆环病毒（PCV）。圆环病毒在人类中较为罕见。近期，中国科学院昆明动物研究所郑永唐研究员和上海市公共卫生临床中心张驰宇研究员团队合作，首次在云南吸毒人员血浆中报道了一个新的（人类）圆环病毒（命名为HuCV2）。 

　　注射吸毒人群（IDUs）是血源性病毒暴露和传播的高风险人群。研究团队针对2009年采集自云南德宏和临沧州IDUs的血浆样品，开展回顾性血浆病毒组研究。在99个IDUs的血浆病毒组数据中，研究团队从德宏的一个IDU中发现和鉴定了一个新的圆环病毒HuCV2，其完整基因组包含2004个碱基。HuCV2在进化上与PCV3最为相近（基因组水平：60.5%），代表圆环病毒的一个新种。为了确定HuCV2的存在，团队用PCR和qPCR进一步扩大筛查568份来自相同和周边地区的IDUs样品，并在临沧的一个IDU中也鉴定到该病毒。测序及基因组分析显示，2个病毒相似性为98.5%。同期法国巴斯德研究所Marc Eloit团队在一名肝炎患者体内也发现了一个新的圆环病毒（命名为HCirV-1）（Emerg Infect Dis. 2023; 29:286-293）。基因组比较显示，HuCV2与HCirV-1的基因组相似性为81%，表明这2个病毒为同一种圆环病毒的不同亚型。中国团队在提交基因组序列和首次报道HuCV2上均略早于法国团队。 

　　中法两国分别独立从3个流行病学不相关的感染者中发现HuCV2 （HCirV-1），表明该病毒极可能是一种新的人类病毒。我们研究的中国云南省2名HuCV2感染者均为HIV-1和HCV共感染的男性IDUs。两名患者分别于1996和2005被确诊为HIV-1阳性，并于2014和2010年死亡。没有明确信息显示2名患者死于AIDS，且前者曾接受抗病毒治疗。法国的病例则来自曾接受心肺移植的一名61岁的女性肝炎患者，自2020年9月后，可以在该病人的肝脏和血液中检测到HCirV-1。因此，目前不能排除该病毒与肝炎的相关性。 

　　指环病毒作为人体常驻病毒，普遍存在于人体不同组织器官中。研究团队在前期的血浆病毒组研究中发现， HIV-1或HCV/HBV共感染，可以导致IDUs血浆中指环病毒的扩张。这种扩张不仅体现为多样性的增加（即：种的数目和遗传多样性增加），也表现出载量的增加，推测可能与HIV-1或HCV/HBV共感染导致IDUs的疾病状况恶化及免疫系统受损有关。进一步的数据挖掘鉴定了4480个指环病毒的分类单元，其中超过1/3可被定义为新种。 

　　上述研究论文 “Novel circovirus in blood from intravenous drug users, Yunnan, China”于2023年5月发表在美国CDC主办期刊Emerging Infectious Diseases上（2023, 29(5):1015-1019. DOI: 10.3201/eid2905.221617），前期的病毒组研究论文“Plasma virome reveals blooms and transmission of anellovirus in intravenous drug users with HIV-1, HCV and/or HBV infections”于2022年发表在美国微生物学会期刊Microbiology Spectrum上（2022; 10(4):e0144722. DOI: 10.1128/spectrum.01447-22）。上海市公共卫生临床中心李龑鹏副研究员为两篇论文的第一作者，上海市公共卫生临床中心曹乐技术员和中国科学院昆明动物研究所叶梅博士生为病毒组论文的共同第一作者。张驰宇研究员和郑永唐研究员为这两篇研究论文的共同通讯作者。以上研究部分得到了国家自然科学基金，国家重点研发专项及中科院重点部署等项目资助。


　　图. 新型人类环状病毒HuCV2.  A. 二例新型环状病毒阳性患者的来源地；B. HuCV2的基因组结构图，包括一个典型的茎环结构，编码衣壳蛋白的Cap基因和编码复制相关蛋白的Rep基因。C. 本研究发现的HuCV2、同期法国团队报道的HCirV1与其它环状病毒的进化关系图